我想使用 Python 腳本將我的 JSON 數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫 (PDB) 格式。我能夠?qū)⑺鼈冝D(zhuǎn)換為 CSV，但是我無法將它們轉(zhuǎn)換為 PDB 格式。將 JSON 數(shù)據(jù)或 CSV 轉(zhuǎn)換為蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫 (PDB) 的任何幫助將不勝感激？謝謝。
1 回答
MM們
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您可以使用PDB 工具
df?=?pd.read_csv(...)
df.to_csv("myfile.pdb"?,?sep="\t")可能有效。如果失敗，則df.to_csv("myfile.csv" , sep="\t")重命名 from?.csvto.pdb可能會起作用。
看看這個 biopython.org/DIST/docs/tutorial/Tutorial.html#sec177。否則剩下的唯一選擇是在記事本文件中手動制作所有這些縮進(jìn)（可以通過編程方式完成），然后將其另存為 .pdb
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