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比較 rpy2 中的方法

比較 rpy2 中的方法

不負相思意 2022-12-20 14:29:02
我有一個 rpy2 腳本:from rpy2.robjects.packages import importrbinom = importr('binom')from rpy2 import robjectsrobjects.r('''library(binom)p = seq(0,1,.01)coverage = binom.coverage(p, 10, method="bayes", type = "central")$coverage''')我想用它來比較方法列表的結(jié)果:methods = [("bayes", type = "central"),("asymptotic")]for method in methods:    robjects.globalenv["method"] = robjects.r(method)    robjects.r('''library(binom)    p = seq(0,1,0.01)    coverage = binom.coverage(p, 10, method=method)$coverage    ''')第一行給了我:invalid syntax我想包括貝葉斯方法的“類型”,但是當我刪除它以獲取列表中的語法時,我仍然收到錯誤消息:object 'bayes' not found 
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1 回答

?
楊__羊羊

TA貢獻1943條經(jīng)驗 獲得超7個贊

robjects.r()收到一個字符串,因此對于此特定任務(wù),您只需將單詞 method 替換為正確的字符串即可。使用兩個引號(單引號和雙引號)就可以解決問題,因為.replace()會丟棄外部引號并替換文本,同時保留單引號。


from rpy2.robjects.packages import importr

binom = importr('binom')

from rpy2 import robjects


methods = ["'bayes', type='central'","'asymptotic'"]

for method in methods:

    r_string = """library(binom)

    p = seq(0,1,0.01)

    coverage = binom.coverage(p, 10, method=TECHNIQUE)$coverage

    """.replace('TECHNIQUE',method)

    robjects.r(r_string)


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反對 回復 2022-12-20
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