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如何將numba與functools.reduce()一起使用

如何將numba與functools.reduce()一起使用

慕絲7291255 2022-08-25 15:16:07
我有以下代碼,我試圖使用并行循環(huán),并且:numbafunctools.reduce()mulimport numpy as npfrom itertools import productfrom functools import reducefrom operator import mulfrom numba import jit, prangelst = [[1, 2, 3], [4, 5, 6], [7, 8, 9]]arr = np.array(lst)n = 3flat = np.ravel(arr).tolist()gen = np.array([list(a) for a in product(flat, repeat=n)])@jit(nopython=True, parallel=True)def mtp(gen):    results = np.empty(gen.shape[0])    for i in prange(gen.shape[0]):        results[i] = reduce(mul, gen[i], initializer=None)    return resultsmtp(gen)但這給了我一個(gè)錯(cuò)誤:---------------------------------------------------------------------------TypingError                               Traceback (most recent call last)<ipython-input-503-cd6ef880fd4a> in <module>     10         results[i] = reduce(mul, gen[i], initializer=None)     11     return results---> 12 mtp(gen)~\Anaconda3\lib\site-packages\numba\dispatcher.py in _compile_for_args(self, *args, **kws)    399                 e.patch_message(msg)    400 --> 401             error_rewrite(e, 'typing')    402         except errors.UnsupportedError as e:    403             # Something unsupported is present in the user code, add help info~\Anaconda3\lib\site-packages\numba\dispatcher.py in error_rewrite(e, issue_type)    342                 raise e    343             else:--> 344                 reraise(type(e), e, None)    345     346         argtypes = []~\Anaconda3\lib\site-packages\numba\six.py in reraise(tp, value, tb)    666             value = tp()    667         if value.__traceback__ is not tb:--> 668             raise value.with_traceback(tb)    669         raise value    670 我不確定我哪里做錯(cuò)了。任何人都可以給我指出正確的方向嗎?非常感謝。
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1 回答

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Cats萌萌

TA貢獻(xiàn)1805條經(jīng)驗(yàn) 獲得超9個(gè)贊

您可以在 numba jitted 函數(shù)中使用 np.prod:


n = 3

lst = [[1, 2, 3], [4, 5, 6], [7, 8, 9]]

arr = np.array(lst)

flat = np.ravel(arr).tolist()

gen = [list(a) for a in product(flat, repeat=n)]


@jit(nopython=True, parallel=True)

def mtp(gen):

    results = np.empty(len(gen))

    for i in prange(len(gen)):

        results[i] = np.prod(gen[i])

    return results

或者,您可以使用如下所示的reduce(感謝@stuartarchibald指出這一點(diǎn)),盡管并行化在下面不起作用(至少?gòu)膎umba 0.48開(kāi)始):


import numpy as np

from itertools import product

from functools import reduce

from operator import mul

from numba import njit, prange


lst = [[1, 2, 3], [4, 5, 6], [7, 8, 9]]

arr = np.array(lst)

n = 3

flat = np.ravel(arr).tolist()

gen = np.array([list(a) for a in product(flat, repeat=n)])


@njit

def mul_wrapper(x, y):

    return mul(x, y)


@njit

def mtp(gen):

    results = np.empty(gen.shape[0])

    for i in prange(gen.shape[0]):

        results[i] = reduce(mul_wrapper, gen[i], None)

    return results


print(mtp(gen))

或者,因?yàn)镹umba內(nèi)部有一點(diǎn)魔力,可以發(fā)現(xiàn)將轉(zhuǎn)義函數(shù)并編譯它們的閉包。(再次感謝@stuartarchibald),你可以這樣,在下面:


@njit

def mtp(gen):

    results = np.empty(gen.shape[0])

    def op(x, y):

        return mul(x, y)

    for i in prange(gen.shape[0]):

        results[i] = reduce(op, gen[i], None)

    return results

但同樣,并行在numba 0.48之前在這里不起作用。


請(qǐng)注意,核心開(kāi)發(fā)團(tuán)隊(duì)成員推薦的方法是采用第一個(gè)使用 .它可以與并行標(biāo)志一起使用,并具有更直接的實(shí)現(xiàn)。np.prod


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反對(duì) 回復(fù) 2022-08-25
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