我正在嘗試在Python Docker映像中安裝多個(gè)R包。我有這個(gè)?。篋ockerfile# Python 3.7.5FROM python:3.7.5ENV PYTHONUNBUFFERED 1# Install R 3.6RUN echo 'deb http://cran.rstudio.com/bin/linux/debian buster-cran35/' >> /etc/apt/sources.listRUN apt install dirmngrRUN apt-key adv --keyserver keys.gnupg.net --recv-key 'E19F5F87128899B192B1A2C2AD5F960A256A04AF'RUN apt updateRUN apt install -y r-base # Install R dependenciesRUN R -e "install.packages('BiocManager', dependencies=TRUE, repos='http://cran.rstudio.com/')"它不會(huì)引發(fā)任何錯(cuò)誤。但是當(dāng)我跑步并做：docker container exec -it <my container> bashRscript -e 'installed.packages()' | grep BiocManager沒有任何結(jié)果。我不知道這是否適用，但在構(gòu)建過程中它會(huì)拋出：下載的源包位于'/tmp/Rtmp7jBLWQ/downloaded_packages'也許它在臨時(shí)文件夾上安裝軟件包是問題所在。有沒有辦法安裝 R 包，而無需基于 R 基礎(chǔ)映像和使用映像？install2.r
1 回答
Helenr
TA貢獻(xiàn)1780條經(jīng)驗(yàn) 獲得超4個(gè)贊
真可惜...我有一個(gè)帶有子句的docker-compose，我忘記運(yùn)行。這就是更改未應(yīng)用的原因。build: .docker-compose build
但是，我使用 r-base 映像以更簡(jiǎn)單的方式安裝依賴項(xiàng)。我的最后一個(gè)是：Dockerfile
FROM r-base:3.6.2
# Install R dependencies
RUN install2.r --error BiocManager
# Install Python 3.7
RUN apt install -y python3.7 python3-pip
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