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Python 中的生命線生存分析。該方法的部分風(fēng)險(xiǎn)是什么?

Python 中的生命線生存分析。該方法的部分風(fēng)險(xiǎn)是什么?

牛魔王的故事 2021-08-05 17:06:59
我正在嘗試使用 Python Lifelines 包來校準(zhǔn)和使用 Cox 比例風(fēng)險(xiǎn)模型。所以,結(jié)果總結(jié)是:coef  exp(coef)  se(coef)        z      p  lower 0.95  upper 0.95 PD    -1.1446     0.3183    0.0814 -14.0563 0.0000     -1.3042     -0.9850  ***oil   -0.1275     0.8803    0.0016 -79.2128 0.0000     -0.1306     -0.1243  ***curr  -0.1353     0.8735    0.0020 -67.3416 0.0000     -0.1392     -0.1313  ***matur -0.0002     0.9998    0.0000 -13.6039 0.0000     -0.0002     -0.0002  ***Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1Concordance = 0.602然后我需要計(jì)算部分風(fēng)險(xiǎn),例如,使用我的生存數(shù)據(jù)選項(xiàng)卡的第一行,即:PD  oil curr    Durat   binar   matur0   0.135760    62.799048   59.004243   1.446575    0   179它必須是這樣的:PD = 0.13576oil = 62.799048curr = 59.004243matur = 179np.exp(-1.1446*PD - 0.1275*oil - 0.1353*curr -0.0002*matur)并且等于 9.387106981409155e-08,所以它是非常小的數(shù)字并且導(dǎo)致所有 t 的生存概率等于 1.0。但是當(dāng)我得到一個(gè) cph.predict_partial_hazard(cox_surv) 方法時(shí),它給了我類似 0.32 的值,我認(rèn)為這是正確的數(shù)字。例如,我們有 Baseline SP = 0.7 并且通過 (0.7^0.32) 到部分風(fēng)險(xiǎn),我們會(huì)得到類似 0.892136633056215 的值,這是正常的。什么是錯(cuò)誤?我們?nèi)绾我哉_的方式計(jì)算部分風(fēng)險(xiǎn)?非常感謝!
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犯罪嫌疑人X

TA貢獻(xiàn)2080條經(jīng)驗(yàn) 獲得超4個(gè)贊

生命線的作者在這里。

生命線中的部分風(fēng)險(xiǎn)是通過首先去除變量的含義來計(jì)算的,因此在生命線中,計(jì)算類似于

np.exp(-1.1446*(PD-mean_PD) - 0.1275*(oil-mean_oil) - 
          0.1353*(curr-mean_curr) -0.0002*(matur-mean_matur))

這可能會(huì)給您帶來更大的部分風(fēng)險(xiǎn)(但是所有科目的相對(duì)排名保持不變)。

文檔字符串沒有提到這一點(diǎn),但是,我會(huì)在 v0.15.0 中修復(fù)它。


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反對(duì) 回復(fù) 2021-08-05
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