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求局部最大值和極小值

求局部最大值和極小值

青春有我 2019-08-03 13:03:16
求局部最大值和極小值我正在尋找一種計(jì)算效率高的方法來為R中的大量數(shù)字尋找局部極大值/極小值,希望沒有for循環(huán).。例如,如果我有一個(gè)數(shù)據(jù)文件,如1 2 3 2 1 1 2 1,我希望函數(shù)返回3和7,這是局部最大值的位置。
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3 回答

?
楊__羊羊

TA貢獻(xiàn)1943條經(jīng)驗(yàn) 獲得超7個(gè)贊

使用動(dòng)物園庫函數(shù)ROLLApply:

x <- c(1, 2, 3, 2, 1, 1, 2, 1)library(zoo)
 xz <- as.zoo(x)
 rollapply(xz, 3, function(x) which.min(x)==2)#    2     3     4     5     6     7 #FALSE FALSE FALSE  TRUE FALSE FALSE 
 rollapply(xz, 3, function(x) which.max(x)==2)#    2     3     4     5     6     7 #FALSE  TRUE FALSE FALSE FALSE  TRUE

然后,使用‘CoreData’對(duì)‘wh.max’是一個(gè)“中心值”表示局部最大值的值提取索引。顯然,對(duì)于局部極小值,您也可以使用which.min而不是which.max.

 rxz <- rollapply(xz, 3, function(x) which.max(x)==2)
 index(rxz)[coredata(rxz)]#[1] 3 7

我假設(shè)你不想要開始值或結(jié)束值,但是如果你想要,你可以在處理之前先把矢量的末端墊好,就像端粒在染色體上一樣。

(我注意到了ppc軟件包(用于進(jìn)行質(zhì)譜分析的“峰值概率對(duì)比”),僅僅是因?yàn)樵陂喿x@BenBolker上面的評(píng)論之前,我還不知道它的可用性,我認(rèn)為添加這幾個(gè)詞將增加具有大眾興趣的人在搜索中看到這一點(diǎn)的可能性。)




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反對(duì) 回復(fù) 2019-08-04
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