R中調(diào)試的一般建議我在使用我編寫的R函數(shù)時(shí)出錯(cuò)：Warning messages:1: glm.fit: algorithm did not converge
2: glm.fit: algorithm did not converge我所做的：逐步完成功能添加打印以找出錯(cuò)誤發(fā)生在哪一行，這意味著兩個(gè)不應(yīng)該使用的函數(shù)glm.fit..他們是window()和save().我的一般方法包括添加print和stop命令，并逐行遍歷函數(shù)，直到找到異常為止。但是，我不清楚這些技術(shù)是從代碼中產(chǎn)生錯(cuò)誤的。我甚至不確定代碼中的哪些函數(shù)依賴于glm.fit..我該如何診斷這個(gè)問題？
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莫回?zé)o
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當(dāng)發(fā)生錯(cuò)誤時(shí)，我通常做的第一件事是通過調(diào)用 traceback()：這顯示了錯(cuò)誤發(fā)生的位置，如果您有幾個(gè)嵌套函數(shù)，這一點(diǎn)尤其有用。 接下來我會(huì) options(error=recover)這會(huì)立即切換到出現(xiàn)錯(cuò)誤的瀏覽器模式，這樣您就可以從那里瀏覽工作區(qū)。 如果我仍然沒有足夠的信息，我通常使用 debug()函數(shù)并逐行遍歷腳本。
findLineNum()setBreakpoint()
try()tryCatch()
MYYA
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Rprof()summaryRprof()profr
集 options(warn=2)將警告視為錯(cuò)誤
options
集 options(error=recover)跑 recover()當(dāng)發(fā)生錯(cuò)誤時(shí)，正如Shane所指出的(如 ..或者任何其他你認(rèn)為有用的函數(shù)都可以運(yùn)行。
將內(nèi)部函數(shù)調(diào)用包裝為 try()若要返回更多信息，請執(zhí)行以下操作。 對于*應(yīng)用函數(shù)，使用 .inform=TRUE(來自plyr包)作為Apply命令的選項(xiàng)
browser()
放入您可能要調(diào)試的函數(shù)中。 browser(expr=isTRUE(getOption("myDebug")))并將全局選項(xiàng)設(shè)置為 options(myDebug=TRUE)您甚至可以包裝瀏覽器調(diào)用： myBrowse <- browser(expr=isTRUE(getOption("myDebug")))然后打電話給 myBrowse()因?yàn)樗褂昧巳帧?/trans>
findLineNum()獲取源文件名和行號，并返回函數(shù)和環(huán)境。當(dāng)你 source()一個(gè).R文件，它在#n行返回一個(gè)錯(cuò)誤，但是您需要知道#n行中的函數(shù)是什么。 setBreakpoint()獲取源文件名和行號，并在其中設(shè)置斷點(diǎn)。
checkUsage
setBreakpoint()trace()
fixInNamespaceassignInNamespace
options(error=dump.frames)
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