第七色在线视频,2021少妇久久久久久久久久,亚洲欧洲精品成人久久av18,亚洲国产精品特色大片观看完整版,孙宇晨将参加特朗普的晚宴

為了賬號(hào)安全,請(qǐng)及時(shí)綁定郵箱和手機(jī)立即綁定
已解決430363個(gè)問題,去搜搜看,總會(huì)有你想問的

用數(shù)據(jù)庫處理大量純文本

用數(shù)據(jù)庫處理大量純文本

蝴蝶不菲 2019-04-10 20:47:40
我本職是研究結(jié)構(gòu)生物學(xué)的,經(jīng)常需要寫腳本程序來處理大量純文本,對(duì)于同一個(gè)蛋白質(zhì),有很多種格式的數(shù)據(jù),比如:pdb格式ATOM1NMET144.017-3.1949.239ATOM2CAMET143.506-1.8299.263ATOM3CMET142.074-1.8399.749ATOM4OMET141.422-2.8489.638ATOM5CBMET143.723-1.2157.865fasta格式>./3odiA165MVNPTVFFDIAVDGEPLGRVSFELFADKVPKTAENFRALSTGEKGFGYKGSCFHRIIPGFMCQGGDFTRHNGTGGKSIYGEKFEDENFILKHTGPGILSMANAGPNTNGSQFFICTAKTEWLDGKHVVFGKVKEGMNIVEAMERFGSRNGKTSKKITIADCGQLE我通常通過后綴名來分辨,比如3odiA.pdb和3odiA.fasta.但bash或者python腳本寫起來需要考慮文件路徑,十分繁瑣.我想數(shù)據(jù)庫應(yīng)該可以很好地解決我的問題,比如用3odiA作key,文本中的strings作value,但是要具體實(shí)現(xiàn)起來確實(shí)沒什么經(jīng)驗(yàn)(非cs出身).各位可否給一些建議?比如,用什么數(shù)據(jù)庫?有什么類似的解決方案可供參考的?
查看完整描述

2 回答

?
HUX布斯

TA貢獻(xiàn)1876條經(jīng)驗(yàn) 獲得超6個(gè)贊

據(jù)我所知,生物學(xué)都是perl黨,perl雖然有點(diǎn)晦澀,但確實(shí)是玩純文本最溜的語言
不如說至今通行的正則還叫pcre=兼容perl的正則表達(dá)式
                            
查看完整回答
反對(duì) 回復(fù) 2019-04-10
  • 2 回答
  • 0 關(guān)注
  • 351 瀏覽
慕課專欄
更多

添加回答

舉報(bào)

0/150
提交
取消
微信客服

購課補(bǔ)貼
聯(lián)系客服咨詢優(yōu)惠詳情

幫助反饋 APP下載

慕課網(wǎng)APP
您的移動(dòng)學(xué)習(xí)伙伴

公眾號(hào)

掃描二維碼
關(guān)注慕課網(wǎng)微信公眾號(hào)