同樣建NJ樹(shù)，為什么MEGA算得那么快，phylip算nj之前要算dist，mega也算嗎？
——沒(méi)用過(guò)phlip，不知道具體情況，但是構(gòu)建NJ樹(shù)的基礎(chǔ)都是先計(jì)算出兩兩距離，然后再根據(jù)距離大小畫(huà)出樹(shù)圖，至于為啥MEGA要快，可能是程序編輯的不一樣吧，就像我用PAUP計(jì)算MP和NJ樹(shù)時(shí)，特別是序列很多的時(shí)候，比MEGA快得不是一倍兩倍。