DNA序列進(jìn)化的初級(jí)分析
首先將自己的序列組比對(duì)后存成*.phy文件（eg. 1.phy),copy一份到phylip文件夾內(nèi)。
1.建NJ樹
打開seqboot.exe
輸入文件名：1.phy
odd number: (4N+1)(eg: 1)
r為bootstrap的次數(shù)，一般為1000 （設(shè)你輸入的值為m）
改好了y
得到outfile（在phylip文件夾內(nèi)）
改名為2.txt
打開Dnadist
輸入2.txt
M ＝m
y
得到outfile（在phylip文件夾內(nèi)）
改名為3.txt
打開Neighboor
3.txt
M=m
y
得到outfile和treefile（在phylip文件夾內(nèi)）
改treefile為4.txt
打開consensus
4.txt
y
得到outfile和treefile（在phylip文件夾內(nèi)）
treefile可直接改為*.tre文件，在treeview里看。