简化总结一下吧，也是看的百度的一些零散的：
一、背景：
1、首先，在Eclipse中新建一个hello工程，Workspace的位置在c:\eclipse\workspace，所以hello工程的位置就是在%Workspace%\hello\这个文件夹中。
2、然后Run as中选择“Run on server”，这时在浏览器（Eclipse当中的Web Browser）中就有了我们想看到的东西，其中url=http://localhost/hello/（隐含index.jsp）！
二、简单原理说明：
1、在MyEclipse的做法（MyEclipse有，Eclipse没有的方法）是：将你的工程拷贝一份到Tomcat目录中的webapps\目录当中，这样Tomcat就多了一个站点，自然可以访问。
2、在Eclipse中的做法不太一样，Eclipse调用了JDK中的JAVAw.exe，并且指定了许多参数，如：

 %JAVA_HOME%\bin\javaw.exe 
-Dcatalina.base=C:\eclipse\workspace\.metadata\.plugins\org.eclipse.wst.server.core\tmp1 "-Dcatalina.home=c:\Tomcat 6.0"  -Dwtp.deploy=C:\eclipse\workspace\.metadata\.plugins\org.eclipse.wst.server.core\tmp1\wtpwebapps "-Djava............." 

此时，打开文件夹：
C:\eclipse\workspace.metadata.plugins\org.eclipse.wst.server.core\tmp1 你可以看到的是类似Tomcat目录下的结构，在wtpwebapps中就有你所有的工程拷贝（即Workspace目录下的project）。如果你访问http://localhost可能提示你404找不到页面，但是在你的Tomcat下的ROOT里确实有文件，并且现在你用Tomcat的webApps下的站点都无法使用，原因就在于Eclipse更改了（使用参数，临时更改，关闭Eclipse中的Tomcat服务，Tomcat恢复原样）Tomcat的webapp主目录（就是-Dcatalina.base=...）。
3、eclipse映射的这个文件夹tmp1结构，与tomcat的根目录结构基本一致。
我们看找到下面这个标签

<Host appBase="webapps" autoDeploy="true" name="localhost" unpackWARs="true" xmlNamespaceAware="false" xmlValidation="false">

在下面就有了两个Context的虚拟目录项，一共两个：
第一个指定了ROOT（这里面什么文件也没，所以无法访问http://localhost/），和工程没关系，第二个和第二个是我的Hello工程，看看，都有了docBase和相对url的path了吧。所以在浏览器中才能访问到hello的jsp页面。
第一个：Context

<Context docBase="C:\eclipse\workspace\.metadata\.plugins\org.eclipse.wst.server.core\tmp1\wtpwebapps\ROOT" path="" reloadable="false"/>  

第二个：Context

<Context docBase="C:\eclipse\workspace\.metadata\.plugins\org.eclipse.wst.server.core\tmp1\wtpwebapps\hello" path="/hello" reloadable="false" source="org.eclipse.jst.jee.server:hello"/>  

写在最后：
路径太深，也不方便，手动修改一下eclipse中工程的发布路径就好，注意修改路径名webapps！
如下图（先清空tomcat中的所有工程，再双击tomcat，即可修改）

最后再啰嗦几句吧：

<Context docBase="C:\eclipse\workspace\.metadata\.plugins\org.eclipse.wst.server.core\tmp1\wtpwebapps\hello" path="/hello" reloadable="false" source="org.eclipse.jst.jee.server:hello"/>  

这个 source="org.eclipse.jst.jee.server:hello"，它实际上并不是直接给 Tomcat 用的，而是eclipse调用插件在 "Publish" 时处理过一次后才交给 Tomcat。

以上就是对这部分小地方的大体了解。（多多交流和补充，靠各位了！新年快乐）