用tbtools转换格式
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复制第二列序列数据到一个新文本文档onlyseq.txt,并把所有*删除
处理excel文件最后得到如下格式文件
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2 motif分析及可视化MEME
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等待。。。
下载MAST xml文件
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可以在线查看 MAST HTML output链接
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打开TBtools
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也可以用
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3基于domain分析成员结构域的保守型与可视化
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/bwrpsb/bwrpsb.cgi
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对比motif和domain看下
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domain不怎好看,可以修改hit文件
缺失的序列补回来
另外,可以用下面方式手动修改更好的展示
4 基因结构分析(包含内含子,UTR)
TBtools
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菠萝中内含子少,而拟南芥中很多
5 基因染色体分布情况可视化
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作者:Y大宽
链接:https://www.jianshu.com/p/756b2de78226
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